1）细菌性病原微生物感染与免疫
2）病原微生物快速检测方法
3）细菌性疾病防控

科研成果：
1、2024-2027 病原体精准识别检测与计量溯源关键技术研究及应用 国家重点研发计划（项目） 项目负责人 1386万
2、2021-2026 适配体和核糖开关的精准设计与高效合成 国家重点研发计划（任务） 项目负责人 116万
3、2016-2020 家禽重要细菌病快速检测新技术研究 国家重点研发计划（课题），项目负责人 540万元
4、2015-2019 表观修饰与病原细菌适应性进化 国家973课题，项目负责人 120万元
5、2022 - 2025 外膜囊泡相关外泌性SRNA介导禽致病性大肠杆菌血流感染的分子机制 国家自然科学基金面上项目 项目负责人 58万元
6、2019-2022 禽致病性大肠杆菌外膜囊泡（OMVs）关键效应蛋白的鉴定及其致巨噬细胞损伤的机制研究 国家自然科学基金面上项目 项目负责人 59万元
7、2017-2020 sRNA调控禽致病性大肠杆菌在巨噬细胞内存活的分子机制 国家自然科学基金面上项目 项目负责人 62万元
成果简介：
1. 解析肠道外致病性大肠杆菌的致病机制
围绕肠外致病性大肠杆菌的致病机制与人兽共患潜力展开系统研究。解析了致脑膜炎大肠杆菌突破血脑屏障的跨细胞机制及宿主免疫清除路径（Nature Communications 2025）；阐明了肠外致病性大肠杆菌携带胞质的外膜囊泡形成依赖RecA/LexA介导的SOS反应；揭示了肠外致病性大肠杆菌外膜囊泡通过TLR4通路激活巨噬细胞炎症反应，诱导中性粒细胞胞外陷阱并损伤巨噬细胞的机制（PLoS pathogens 2022）；解析了ST117谱系肠外致病性大肠杆菌的基因组特征；发现肠外致病性大肠杆菌通过多种外膜碳水化合物代谢酶结合补体蛋白FH以逃避补体杀伤；揭示肠外致病性大肠杆菌的乙酸同化系统促进其在巨噬细胞内复制，是毒力及定植的重要因子等；为肠外致病性大肠杆菌的检测和防控提供了关键理论依据。
2. 开发新型侧流层析技术实现致病菌快速检测
将硼酸分子取代捕获抗体，实现胶体金无抗体标记；利用纳米酶原位催化策略，实现比色信号增强，均成功应用于侧流免疫层析技术，可快速高效地检测病原微生物，灵敏度至少提高3个数量级，成本降低至30%（Analytical Chemistry 2025/2022；Chemical Engineering Journal 2023；Nano Letters, 2024）。
3. 研发噬菌体制剂防治耐药菌感染
为应对严峻的细菌耐药现象，开发噬菌体制剂防控耐药菌的感染。针对常见的耐药性病原菌，如肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、沙门菌、大肠杆菌等分离并筛选有效的裂性噬菌体；解析噬菌体利用Hoc蛋白与黏蛋白MUC互作促进噬菌体黏附于肠黏膜从而保护肠道免受病原菌侵袭的机制（Nature Communications 2024）；解析了噬菌体对不同病原菌的受体识别机制；开发微囊化噬菌体制剂，提高噬菌体对胃肠道及环境的耐受性和体内的杀菌效率；并基于以上发现开发宽宿主谱、高效的噬菌体鸡尾酒制剂，探索对耐药菌的生物防治。

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